Este programa teve o objetivo de assegurar a diversidade biológica da fauna aquática, garantindo sua conservação. Para isso, a Investco formalizou um contrato com a Unitins, campus de Porto Nacional. Com a parceria, foi construída uma escada de peixes para a subida e descida da ictiofauna, garantindo o acesso aos dois lados da barragem.
As atividades deste programa compreenderam a marcação de peixes, a implantação da escada de peixes, o resgate de peixes nas instalações da UHE e a preservação de áreas de desova e criadouros naturais.
As ações inicialmente previstas neste programa foram concluídas, mas a Investco dá continuidade ao monitoramento e a outras pesquisas, através do Núcleo de Estudos Ambientais da Fundação da Universidade Federal do Tocantins (NEAMB). Dentre as novas pesquisas está o estudo do comportamento dos peixes, sendo necessário o bloqueio temporário do mecanismo de transposição de peixes.